有媒体报道，陕西商洛地区制药厂从1998年2月起，在商洛行署主持参与下，仅用了半年时间就完成改制，采用“分立重组、等量资产承担等量债务”的形式组建了香菊制药有限责任公司(简称香菊公司)。现在，政府认为，企业改制出资不到位，并且集体股量化不合理，所以香菊公司应是由老企业工会控股的集体控股企业。

分析人士指出，由于改制进行得过于匆忙，许多企业在改制之后都涌现出种种纠纷。例如，西北过去最大的面粉加工企业——西安人民面粉厂在决定改制之后，许多职工于1999年8月起纷纷交纳股金，但股金交了之后，各项手续都没有办理，直到现在，5年过去了，他们仍不知道自己占有多少股份。西安市粮食局一位干部称，对改制中的不规范问题，政府部门也很头痛。一方面这些存在的问题迟早都应该规范，需要矛盾双方之外的第三方进行协调。但另一方面，政府对这些企业又不能管得太多，许多改制企业已经没有国有股份，完全成了民营企业，政府管得太多也很不合适。对这类改制企业，政府不管有问题，但管得太多明显也不合理。如何管理、规范已经完成改制的企业，是当前应该探索的一个课题。