据了解，绝大多数外资在华投资的行业是第二产业中的制造行业，协议投资金额达到全部协议金额的60%左右；房地产业也达到10%以上。商务部研究院徐剑明表示，我国对外资的利用过于集中在成熟行业，外资未能充分引导新兴行业的开发，在一定程度上加剧了产业结构的失衡。

制造业的劳动密集型投资多于技术密集型投资，结果使其成为外商转移过时设备和技术的接收者，也抑制了我国在机械制造方面的自主研发能力。自20世纪90年代初以来投资过热的势头始终未能得到有效遏制。截至2000年底，全国商品房的空置面积已达9000多万平方米，外资在这一领域的大规模介入，无疑起到了推波助澜的作用。而对于当前我国经济发展急需的高新行业和资金短缺行业，如交通运输、电信通讯、科技服务业、教育文化业和农林牧渔业等，外资并未能给予积极的资金补充。长期以来90%以上的外国直接投资集中在东部沿海地区。2002年中西部地区吸引外资仅占我国利用外资总额的13.31%。吉林、河南、山西、重庆、甘肃、新疆和四川等地利用外资增幅均出现了程度不同的负增长。